南京中醫藥大學常熟附屬醫院、常熟市中醫院(新區醫院、婦保院)坐落在黃河路東端。是由原常熟市中醫院和常熟市婦幼保健院于2003年12月合并重組而成。醫院占地6．8萬平方米，建筑面積5．8萬平方米；主體建筑由15層住院大樓、4層門診樓和2層急診樓組成，輔以藥劑(制劑)樓、高校實習生宿舍及后勤設施用房。
　　常熟市中醫院建有“常熟中醫藥博物館”，以實物和圖片方式展示了常熟中醫的歷史發展，治未病中心和國藥精品館為拓展中醫藥應用搭建了良好的平臺。
　　原常熟市中醫院和常熟市婦保院都有五十多年的發展歷史，合并重組后以急診急救、中醫中藥和婦幼保健為三大支柱，成為一所具有較強醫療技術、臨床教育和科研能力的的二級甲等醫院，江蘇省高校實習基地，衛生部國際救援中心認定的“國際緊急救援中心網絡醫院”及聯合國兒童基金會和世界衛生組織命名的“愛嬰醫院”，美國南加州醫科大學友好醫院。2006年以來組建了以海虞衛生院、福山衛生院、周行衛生院、滸浦衛生院、碧溪衛生院、吳市衛生院、董浜衛生院等為成員單位的醫療服務集團。
　　常熟市中醫院現有在編職工760人，其中衛技人員668人。擁有南京中醫藥大學兼職教授5人、副教授25人；博士學位3人、碩士學位28人。醫院核定床位580張(包括分院)，設有內、外、婦、產、兒(新生兒)、肛腸、骨傷、腦科中心、重癥監護、康復等15個病區。其中：中西醫結合肛腸病診療中心、骨傷科為蘇州市中醫重點專科；新生兒科、腎內科為常熟市重點專科；腫瘤科、針灸科、男科、中醫婦科為常熟市中醫特色專科。作為南京中醫藥大學附屬醫院，醫院積極探索中醫發展之路，形成了較為鮮明的中醫特色。目前，擁有中醫專業技術人員100位，其中，江蘇省名中醫3位、醫院首席中醫師5位、蘇州市名中西醫結合醫師6位，高級職稱33位、中級職稱37位。
　　為了充分繼承和發揚中醫藥事業而成立的三個名中醫工作室，不僅致力于挖掘和繼承三位省名中醫的學術思想和臨癥經驗，而且在中醫師承教育方面探索了一條新路。中醫專科方面，兩個蘇州市中醫重點專科和三個常熟市中醫特色專科，近年來也得到了長足的發展。
　　常熟市中醫院中西醫結合肛腸病診療中心是在常熟市中醫院肛腸科基礎上創建的，是全國中醫特色專科建設單位、蘇州市重點專科、常熟市中醫特色專科。該中心創建于1958年，近半個世紀來，治愈各種肛腸病患者數以萬計，在常熟及周邊地區具有很高的知名度，是蘇州市規模最大、技術力量最強，具有廣泛影響的肛腸聊盒子賺錢網病特色專科。診療中心技術力量強大，目前有副主任中醫師5名、主治醫師2名、住院醫師3名，其中蘇州市名中西醫結合醫師2名。中心的自制制劑獨樹一幟，該科研制的中藥制劑“洗必靈洗劑”、“復方黃連油膏”、“痔斷根片”等經多年臨床應用，療效顯著，獲得廣泛好評。中心主要診療范圍有：內痔、外痔、混合痔、肛裂、肛門狹窄、肛乳頭肥大、肛周膿腫、肛瘺、直腸息肉、早期局限性肛門直腸部腫瘤，潰瘍性結腸炎、克隆病（crohn病）、腸易激綜合征、慢性功能性便秘等各種肛腸疾病。
　　中醫骨傷科因其在國內首創手法推拿治療腰椎間盤突出癥效果顯著而享譽全國，中西醫結合方法診治骨傷科專業的疾病為本專科的主要特色。應用全麻下手法按摩術、骨盆牽引、骶管滴注等方法保守治療腰椎間盤突出癥，采用推拿、枕頜牽引及膏藥穴位敷貼治療頸椎病。運用現代技術和傳統方法，對多種骨折、不同疾病和畸形的整復治療。針灸科以中醫經驗理論為依據，針灸結合中藥、配合電針療法、磁熱療法、經絡測評療法治療各種癱癥、痛癥；推拿科采用滾、拿、推、震、抖等手法治療MPS，嬰幼兒腹瀉、面癱等，療效獨特。
　　中醫婦科在省名中醫邵亨元先生的帶領下，以中醫經典理論為指導，治療各種婦科慢性病，特別對女性不孕不育癥療效獨特，影響甚廣。
　　中醫腫瘤科以中醫中藥為主要方法綜合治療各種腫瘤，以中醫中藥為主，配合化療、介入治療及生物治療，辯證施治與辯病論治相結合，充分發揮了中西結合在中晚期腫瘤中的優勢，延長了腫瘤患者的生存期，提高了生活質量。專科以其濃郁的中醫特色被評為常熟市中醫特色專科。
　　腎內科以傳統的中醫辨證施治，結合現代醫學的檢測治療手段診治各種腎臟疾病，主要有；急慢性腎小球腎炎、腎病綜合癥，急慢性腎功能不全，急慢性尿路感染，尿路結石，各種繼發性腎臟病如狼瘡腎炎，紫癜性腎炎，高血壓腎病，糖尿病腎病，尿酸性腎病及多囊腎，腎結核等及各種中毒性臨床的搶救。成為常熟市首家中西醫結合腎病專科。另外，中醫外科、推拿科也在繼續發揮專科優勢，在治療瘡瘍、癰癤和軟組織慢性損傷、嬰幼兒腹瀉、先天性肌性斜頸、面癱等方面獨樹一幟。
　　按照制劑室建設規范進行建設的中藥制劑室為本市獨有，采用本院名方、驗方生產的中藥制劑和附設的中藥加工廠，滿足了中醫臨床的需要。
　　常熟市中醫院目前擁有德國西門子16排螺旋CT，西門子800毫安IRCONOS-R200數字胃腸機，西門子800毫安X光攝片機及西門子雙板DR系統，日本富士多通道CR系統，西門子乳腺鉬靶x光機，西門子中型C臂X光機等14臺各類影像設備；內鏡室的日本Pentax數字胃腸鏡，Olympus電子胃腸鏡為消化道病人檢查提供了清晰的內鏡圖像；超聲科擁有GE(Vivid7、Logic7各一臺)、西門子全數字黑白B超、日立（EUB-8500、EUB-6500、EUB-5500各一臺）、Philipsiu22等11臺先進超聲設備；奧林巴斯AU2700全自動生化儀，美國強生全自動干式生化儀，進口五分類全自動血細胞分析儀，全自動酶標儀，全自動發光免疫分析儀，放射免疫血氣分析儀，飛利浦中央心電監護儀，24小時動態心電血壓監護儀。Storz腹腔鏡2臺，施樂輝腹腔鏡，Wolf宮腔鏡。進口血透機28臺，血液濾過，CRRT，單人高壓氧艙2臺，32導腦電分析儀、動態腦電圖儀，多導睡眠呼吸監測儀，進口呼吸機，麻醉監護儀，麻醉機。德國萊卡M841眼科顯微鏡，德國Drager目樂Hi-R1000神經外科顯微鏡，瑞士全自動視野計、眼底激光治療儀、超聲乳化儀等先進的眼科設備。中藥煎煮和中藥自動包裝機，中藥飲片加工、制劑加工等大型醫療設備及制藥器械，總價值為7800多萬元。
　　常熟市中醫院(新區醫院、婦保院)面向新城居民區，輻射港區，交通便捷，全院醫務人員堅持“以人為本”、以“服務與技術并重”為宗旨，竭誠為全市人民提供優質的醫療服務。