南京市秦淮醫(yī)院始建于1950年，是一所二級綜合醫(yī)院。醫(yī)院現(xiàn)有職工240人，其中衛(wèi)技人員1％人，副高職稱以上17人。醫(yī)院臨床科室15個，醫(yī)技科室7個，特色專科門診9個，病區(qū)3個，病床152張。

產(chǎn)科被南京市衛(wèi)生局列為重點專科，負(fù)責(zé)早孕建卡、孕期保健、正常接產(chǎn)以及各種難產(chǎn)處理和產(chǎn)后保健服務(wù)等。婦科開展各種疑難雜病的治療，血液凈化(透析)治療中心始建于1989年，十多年來，治療了眾多尿毒癥、腎功能衰竭病人，1998年被南京市總工會推出為“血透扶貧’’工程，目前，醫(yī)院已成為南京市職工扶貧血透中心、南京市總工會慈善醫(yī)療門診部。為特困企業(yè)職工和下崗職工中需做血液透析的病人減免25％的醫(yī)療費用。糖尿病專科是醫(yī)院的重點血科，技術(shù)力量雄厚，開展胰島功能評估、胰島素泵強(qiáng)化治療等，特別是在整體治療的基礎(chǔ)上應(yīng)用中藥外治糖尿病足潰瘍，取得了很好的療效，深受患者好評。2009年，由秦淮醫(yī)院糖尿病專科組成的團(tuán)隊代表南京隊在全國糖尿病社區(qū)管理比賽中戰(zhàn)勝上海、北京隊，一舉奪得**。醫(yī)院專科門診還開設(shè)了心血管專科，神經(jīng)、康復(fù)專科，消化專科，乳腺病、前列腺專科，疼痛專科等。