中國醫學科學院皮膚病研究所1954年創建于北京，直屬中央衛生部領導。1970年從北京遷至江蘇泰州，1984年遷南京現址，并建立皮膚病醫院。1986年設立全國性病防治研究中心，2005年調整為中國疾病預防控制中心性病控制中心、中國疾病預防控制中心麻風病控制中心。
　　中國醫學科學院皮膚病研究所是我國最早成立的從事皮膚病、性病、麻風病，集臨床、科研、防治和教學為一體的國家級專業機構。為世界衛生組織性傳播疾病預防與控制合作中心、皮膚性病學國家重點學科、博士和碩士學位授予點、國家藥品臨床研究基地、中國微生物菌種保藏管理委員會醫學真菌中心、江蘇省臨床醫學中心、衛生部化妝品皮膚病診斷機構、中國醫學科學院艾滋病研究中心性傳播疾病控制中心、家庭健康國際中國合作中心，同時承擔《中華皮膚科雜志》、《國際皮膚性病學雜志》的編輯和出版任務。
　　中國醫學科學院皮膚病研究所占地4.04萬平方米，建筑面積3.6萬平方米，主要建筑有門診樓、病房樓、醫技樓、科研樓、教育防治業務樓、SPF級實驗動物中心。醫院編制床位100張，設有20多個臨床、科研科室，年接診病員約60萬人次。300余名在職職工中，高級專家62名，博士生導師9名，碩士生導師23名，享受政府特殊津貼專家17名。50余名專家在國家及省級專業委員會任職。現有中青年骨干中，多人當選衛生部突出貢獻專家、新世紀百千萬國家級人選、江蘇省“六大高峰”人才和醫學重點人才。
　　五十載春華秋實，半世紀艱苦創業，全體職工秉承“嚴謹、博精、創新、奉獻”的協和精神，與時俱進，開拓創新，堅持醫教研防齊頭并進，協調發展。醫院充分發揮國家級醫療機構的作用，形成專科、專病特色和優勢；堅持科研興所導向，科研工作成果豐碩；防治工作取得重大成就；國際間學術交流與合作日益擴大和頻繁；人才建設和培養已形成梯隊。經過幾代人不懈努力，院所煥發出勃勃生機，彰顯出強有力的發展后勁，激勵著他們不斷繼承傳統、改革創新，成就又一個輝煌。
　　1954年在北京成立，原名為“中央皮膚性病研究所”，郭沫若題寫所名；
　　1957年更名為“中國醫學科學院皮膚性病研究所”
　　1970年遷至江蘇泰州，易名“江蘇皮膚病防治研究所”；
　　1984年遷南京現址，易名“中國醫學科學院皮膚病研究所”，并建立“中國醫學科學院皮膚病醫院”。
　　1986年在該院設立“全國性病防治研究中心”；2005年更名為“中國CDC性病控制中心”、“中國CDC麻風病控制中心”。　
　　擁有國內最齊全的皮膚病性病學亞學科，并逐步建立以疾病為導向的學科建設模式。皮膚病理專業為國內該領域學科帶頭單位，皮膚真菌學的研究處于國內領先水平；性病臨床和科研是國家公益基金支持項目；皮膚美容治療，尤其是皮膚病的脈沖激光及皮膚病物理療法優勢明顯；皮膚外科近年來發展迅速，成為該領域有影響的隊伍。中國醫學科學院皮膚病研究所在國內最早開展專病診治，經10余年的發展，在重癥大皰病、結締組織病、重癥藥疹的搶救、血管性腫瘤、疑難少見皮膚病和皮膚腫瘤、痤瘡、白癜風等皮膚病的專病診療技術居國內領先水平，年接診病員近60萬人次。
　　建院所以來，承擔國家“七·五”、“八·五”攻關項目、國家自然科學基金、國家重大專項、科技部和衛生部公益專項、江蘇省自然科學基金和國際合作等項目的研究。先后獲國家科技進步一、二、三等獎、全國科學大會獎、部省市級獎和院校獎。每年在國內外核心期刊發表論文100余篇，專著10余部。《中國性病防治之梅毒》在世界著名醫學期刊《柳葉刀》上發表。研制的雷公藤多甙已廣泛用于治療變態反應和免疫相關的疾病，其有效單體的研究被評為國家一類新藥。自行研制皮膚科外用制劑百余種用于臨床，受到病員的廣泛好評。
　　皮膚性病學為教育部重點學科，北京協和醫學院皮膚性病學專業博士、碩士學位授予點，衛生部認定的第一批國家級繼續醫學教育基地、中國醫師協會皮膚病理、真菌、性病及美容專業全國培訓基地。院所培養的皮膚性病學專業博士和碩士研究生，已成為全國三級醫療衛生機構的業務骨干。每年接受進修生100余名，完成10余期國家醫學教育項目，組織20多期培訓班，為各省市基層衛生醫療機構、疾病預防機構，培養皮膚性病專業診療和防治技術骨干，更好地指導基層的醫療衛生和防治工作。
　　院所防治工作者以完成國家任務為己任，經過二十余年不懈努力，已建立起一支具有光榮傳統的，集臨床、防治和科研為一體的團隊，并設立了遍布全國的疫情監測網絡。首任所長胡傳揆教授代表國家在北京國際科學討論會上宣讀了“我國對梅毒的控制與消滅”的論文；“全國控制和基本消滅麻風病的策略和技術措施的研究”、“麻風畸殘防治及康復研究”分別獲得國家科技進步一、二等獎；15屆麻風大會，院所榮獲“全國麻風防治工作先進集體”，實現了本世紀末我國基本消滅麻風病的目標，標志著我國性病、麻風病防治工作取得了舉世矚目的成就。
　　先后與WHO、美國NIH、歐盟、瑞士巴塞爾大學醫學研究中心、國際皮膚病基金會、國際麻風病救濟會、荷蘭麻風基金會、法國佛里豪基金會、日本世川財團等30多個國際組織建立了學術交流與合作。定期邀請國際知名專家來所講學、交流，同時選送優秀中青年醫學、科研人員出國學習和培訓。每年與WHO、歐盟、中英、世行衛九、福特基金等開展了數十項國際合作項目的科學研究。