紹興市第六醫(yī)院創(chuàng)建于1965年，是紹興地區(qū)唯一一家三級乙等傳染病專科醫(yī)院，擔負著全市各類傳染性疾病的診治工作，是融傳染病的預防、醫(yī)療、科研、教學、康復、保健為一體的市級專科醫(yī)院。
紹興市第六醫(yī)院占地面積16008平方米，建筑總面積23000平方米，綠化覆蓋率達35%，開放床位350張，設有11個病區(qū)，9個醫(yī)技科室。現(xiàn)有職工333人，其中衛(wèi)生專業(yè)技術人員286人，高級職稱36人，中級職稱90人。2006年門急診量達到58953人次，住院收治病人3895人次，床位使用率達91.33%。醫(yī)院環(huán)境優(yōu)美、設備先進、技術力量雄厚、硬件設施現(xiàn)代化，擁有全身螺旋CT、百勝彩色B超儀、島津500毫安X光機、人工肝支持系統(tǒng)、LX-20自動生化分析儀、庫爾特流式細胞儀、雅培化學發(fā)光分析儀、德國史托斯腹腔鏡系統(tǒng)、日本奧林派斯膽道鏡、射頻消融儀等儀器設備。是紹興市傳染病的醫(yī)療科研教育中心，附設有：紹興市結核病醫(yī)療中心、浙醫(yī)一院紹興肝病診治中心、肝膽外科診治中心、紹興市亞健康診治中心、紹興市肝病研究所、紹興市老年病研究所等機構。
紹興市第六醫(yī)院醫(yī)療技術精湛、科研成果豐碩，有多項科研項目獲省、市科技進步獎。“病毒性肝炎學科”是市級重點學科，現(xiàn)已成功開展肝臟穿刺活檢、腹水濃縮回輸儀治療頑固性腹水、人工肝支持系統(tǒng)治療重型肝炎、高膽紅素血癥、肝性腦病及脂肝凈治療脂肪肝等新技術、新項目。同時采取中西醫(yī)結合、內外科聯(lián)動的方法，系統(tǒng)治療肝硬化、肝癌及其并發(fā)癥，成功開展了肝硬化腹腔鏡下巨脾切除術、晚期肝癌肝動靜脈埋泵術及肝癌切除術等手術，在社會上樹立了較高的聲譽。“呼吸內科（肺結核方向）”是紹興市第三批臨床醫(yī)學重點學科，現(xiàn)已開展結核桿菌的各類涂片、培養(yǎng)、藥敏及鑒定，“結核分枝桿菌的快速培養(yǎng)及研究”作為一個優(yōu)勢項目在廣泛應用。并能熟練開展纖維支氣管鏡下的多項診斷、治療手段，包括：篩檢、活檢、肺泡灌洗、灌注止血、微波再通等。
紹興市第六醫(yī)院堅持“以病人為中心，以質量為核心”的服務理念，實行“病人擇醫(yī)、擇護制”、“首問負責制”、“收費一日清單制”、“服務承諾制”等管理模式，以優(yōu)質技術、優(yōu)良服務、優(yōu)美環(huán)境、優(yōu)惠價格贏得了社會的好評，取得了經濟效益和社會效益雙豐收。先后榮獲紹興市文明單位、紹興市治安安全單位、紹興市愛國衛(wèi)生先進單位、病人滿意醫(yī)院、市級思想政治工作先進集體、市直衛(wèi)生系統(tǒng)行風建設先進單位、市直衛(wèi)生系統(tǒng)目標責任制考核一等獎單位等榮譽稱號。