蚌埠醫學院第二附屬醫院坐落在風景秀麗的蚌埠市龍子湖畔，東連大學城及高鐵站，西臨市政府，南北相連城市居民區，地理位置優越，交通便利。醫院占地面積120余畝，建筑面積近6萬平方米，綠化面積達86%;，是一所集教學、科研、醫療、預防、康復和社區服務為一體的省直三級綜合醫院。

　　醫院始建于1915年，歲月滄桑，幾經變革，1949年醫院正式掛牌蚌埠鐵路醫院，后逐步發展成為規模較大，技術力量較強，醫療設備先進，學術水平較高的上海鐵路局蚌埠鐵路分局中心醫院，也是全國鐵路系統建院最早的醫院之一。2000年5月醫院與蚌埠醫學院建立非直屬附屬醫院關系。2004年隨著鐵路體制改革，醫院分離出鐵路系統，根據皖政秘[2004]91號文件，2004年8月19日，蚌埠鐵路中心醫院正式移交蚌埠醫學院，正式更名為“蚌埠醫學院第二附屬醫院”，進入安徽省直事業單位管理序列。

　　醫院現有職工864人，其中醫院享受省部級以上政府津貼3人，享受國務院津貼1人，衛生廳學術技術帶頭人1人。20余人擔任省級以上專業學術委員會委員、常委，省級以上學術委員會副主任委員3人。醫院編制床位550張，實際開放床位701張，規模床位800張。設臨床科室26個，醫療技術科室10個。醫院泌尿外科、整形外科、普外科（微創外科）、腎內科（人工腎）、感染性疾病科、腫瘤外科、血液內科、婦產科、心內科、呼吸科、神經內科、婦產科、眼科、口腔科、重癥醫學科等特色專科技術力量雄厚，臨床診療手段在同級醫院中居領先水平。康復科對頸、腰、腿等慢性疾病的治療康復取得一系列研究成果，在治療偏癱上有獨特方法。微創外科、血液透析、核素治療、震波碎石、醫學影像中心等技術優勢相繼形成。檢驗科被國家衛生部臨床檢驗中心授予“全國優秀實驗室”。近年來，醫院堅持科技興院，大力推進新技術應用和科研活動，一批先進的新技術、新療法應用于臨床。目前以有23項科研成果通過省、醫學院和市級鑒定。

　　醫院醫療設備設施在皖東北地區同級醫院中居領先地位。擁有醫院現有美國GE1.5T超導磁共振、飛利浦64排128層CT機，1250mADSA，進口全功能麻醉機、呼吸機、彩色多普勒、血氣分析儀、全自動生化分析儀、ICU、CCU監護設備、血液透析設備、進口超聲乳化白內障治療儀、腦彩超、大型數字減影X光機、數字化X線乳腺成像系統（CR）、體外循環機、C臂X光機、碎石機等大型設備，等一批世界高精尖醫學診療設備。醫院病房大樓設備設施齊全，每個病床配置“三集中”設施，病房有獨立的衛生間、冷熱水、空調、暖氣系統，門（急）診大樓引入現代醫院設計理念，診療科室、候診區域設計科學、合理，彰顯人性化服務特色。

　　醫院擔負著蚌埠醫學院、東南大學醫學院、安徽醫專等6所大中專學校的臨床見習和實習任務。05年該院教學樓投入使用，開始接受蚌埠醫學院醫學本科臨床理論課教學。設有10個臨床教研室，教室、媒體室、示教室、自習室、電子閱覽室和臨床技能培訓中心等教學用房總面積達4200多平方米。擁有碩士研究生導師12人，碩導學位達50余人。醫院圍繞“中國醫學本科教育標準”，結合工作實際，以培養“具有初步臨床能力、終身學習能力、良好職業素質的初級醫生”為總體方向，積極探索教學改革的新路子。積極開展了“三早”醫學教育模式的探索，使醫學生盡早接觸臨床、盡早接觸社會實踐、盡早接觸臨床科研，以期實現對醫學生的“立體式”培養。

　　近年來先后承擔各級各類科研課題45項，其中細菌L型“863”系列培養基的研制等17項科研成果獲得鐵道部科學技術進步獎、安徽省科技進步獎、上海市科技進步獎、上海市優秀發明、上海鐵路局科技進步獎、蚌埠市科技進步獎等榮譽。