泉州兒童醫院(泉州市婦幼保健院)創建于1990年元月，前身是一所僑建公辦的兒童醫院，1997年加掛“泉州市婦幼保健院”牌子，目前實行“一套班子，兩塊牌子、醫療保健兩院合一”的管理模式。院區占地面積36000平方米，建筑面積42000平方米。編制病床500張，員工550人。其中享受國務院特殊津貼專家3人，留美博士1人，碩士11人。高級職稱55人，中級職稱65人。設NICU、PICU、新生兒、神經康復、腎臟血液、哮喘、小兒心血管中心、眼科、婦科、產科和VIP等十二個專業病區和相應的專科門診。是“省新生兒疾病篩查中心泉州分中心”和“省新生兒救護中心泉州分中心”的所在醫院。
泉州兒童醫院主要設備有：眼科準分子激光、螺旋CT、四維彩超、二維彩超、全自動生化、乳腺X光機、腹腔鏡、24小時動態腦電圖、宮腔鏡、視頻腦電圖、腦干誘發電位、麻醉工作站、玻璃體切割機、超聲乳化機、眼底照像系統、間接眼底鏡視頻影像系統、早產兒間接眼底激光治療鏡、五分類血球記數儀和成套的試管嬰兒中心實驗室設備，輔助檢查功能配套、齊全，能為各臨床科室提供全方位的醫技檢查。全院各部門實行計算機網絡管理，出入院結帳快捷、方便。
小兒內科是我院的支柱學科，技術力量雄厚，幾十位高、中級醫護骨干中，享受國務院政府特殊津貼專家三名，居全省同行之首。兒內科分設NICU、PICU、新生兒、神經康復、哮喘、腎臟血液六個專業病區和相應的專科門診。在小兒重癥監護、新生兒缺氧缺血性腦病、小兒癲癇、兒童哮喘、免疫功能低下的診療和兒童個性、行為異常、遺傳病系列研究等領域技術領先、多次榮獲省、市科技進步獎。兒童保健科0-3歲兒童早教、感覺統合訓練、性早熟和鉛中毒防治等方面居全省領先水平。
小兒外科是我院的重點專科，擁有成套的麻醉工作站及先進的監護設備。在《中華小兒外科雜志》編委、小兒外博士王祖耀教授的率領下，成功地開展了包括小兒普外、小兒普胸、小兒骨科、小兒泌尿、小兒整形及新生兒外科等多個亞專業的手術，其中聯體嬰兒分離術及省內首例產房外科手術等多次被省內外新聞媒體報道。許多手術如先天性食道閉鎖食道吻合重建術、新法漏斗胸畸形矯正術、經肛門先天性巨結腸根治術的治療效果達到國內先進水平，目前是福建省綜合實力最強的小兒外科中心。
婦產科擁有一流的凈化產房、貴賓待產室和成套的產前篩查、產前診斷實驗設備。婦科以“微創手信”為特色，在我市率先開展婦科腹腔鏡的檢查與手術治療；產科以“無痛分娩”為支柱，配合“孕期胎兒先天性缺陷的篩查、診斷”和“實行孕產婦、嬰幼兒保健一條龍服務”，富有特色。有較好的前景和業務發展空間。
眼科與北京同仁醫院合作，成套引進國外眼科先進設備，以“連鎖經營”的方式組建“泉州北京同仁眼科中心”，代表國際先進水平的同仁眼科專家長期坐診，多種高難度眼科手術的開展填補了省內眼科診療的空白，達國內先進水平。
小兒心血管中心，是在我國小兒先心病外科創始人丁文祥教授的倡導下，我院與上海兒童醫學中心合作組建的小兒心血管診療機構――“上海市小兒先心病臨床醫學中心泉州分中心”。她成套引進國際心血管外科的先進設備，代表國內小兒心外領先水平的上海專家長期在我院“傳”、“幫”、“帶”。目前，許多高難度的小兒心外手術達省內領先、接近國內先進水平。
泉州兒童醫院堅持以市場為導向，走臨床與保健機構結合的道路，業務建設超常規發展，連續十年年均經濟增長超過30％。十五年來，全院在國家、省級刊物發表學術論文900多篇，16個課題21次榮獲省、市、廳級科技進步獎，碩果累累，成績斐然。