南洋腫瘤醫院創建于1988年，由中國癌癥研究基金會發起創建，經過多年的發展不斷壯大。從2002年起北京南洋腫瘤醫院與醫科院腫瘤醫院建立了密切的合作關系，從此進入了新的發展時期。

目前醫院占地9300m2，建筑面積5200m2，業務用房面積5000m2；資金總計750萬元，固定資金451萬元，流動資金299萬元。所有制形式為股份制。

有內科、外科、婦產科、口腔科、腫瘤科、醫學檢驗科、醫學影像科、中醫科。側重于腫瘤科，以腫瘤病人的住院治療為主，治療方式有放療、化療、中西醫結合。

病房設置：設有套房2間、單人間16間、干部病房28間、雙人間6間、三人間68間，共計120間，可設床位260個。每間病房均配備空調、彩電，部分病房設有衛生間、24小時供應熱水、冰箱、微波爐、沙發等生活用品。

人員情況：職工總數為104人，衛技人員80人，其中醫師25人（主任醫師2人，副主任醫師7人、主治醫師9名）、藥劑人員5人、檢驗人員5人、護理人員44人（主管護師4人、護師5人、護士32人）、口腔技師1人、財會人員2人、其他人員22人。

設備情況：手術室有麻醉機2臺、監護儀2臺、高頻電刀2臺等；麻醉清醒室有呼吸機1臺；檢驗科有全自動生化儀1臺、血球分析儀1臺、血凝分析儀1臺、尿液分析儀1臺、鉀鈉氯分析儀1臺、酶標分析儀1臺等；心超室有心電圖機2臺、B超機3臺；放射科有300mA的X光機1臺、床旁X光機1臺；口腔科有牙椅2臺等；各臨床科室設備齊全。