哈爾濱醫科大學附屬第一醫院始建于1949年，經-過60年的發展，由一所230張床位、395名職工的小型醫院，發展成為集醫療、教學、科研為一體的大型綜合性醫院。
醫院是黑龍江省最大的醫療中心，醫療專科設置齊全，技術力量雄厚。醫院設有門診部、住院處、急診急救中心、遠程會診中心等業務機構，共有93個臨床科室，54個醫技科室，現有員工5111人，副高職稱以上專業人員908人，擁有開放床位4,398張。2012年門、急診量達198.8萬人次，住院手術7.25萬例。醫院同時承擔著副省級以上領導及重要外賓的保健、診療任務。
1992年被評為“三級甲等”醫院；1998年獲全國“百佳醫院”稱號，2010年再次以全省最高分通過三級甲等醫院復審。醫院與省內外90余家醫院結成了協-作醫院，醫療輻射周邊國家和地區。病理科、血液內科、心血管內科、心臟大血管外科、神經外科、神經精神科、中西醫結合腫瘤科、普外科、神經內科、腎內科、眼科、臨床護理部等12個專科被評為國家臨床重點專科建設項目，血液內科、神經外科等23個專科成為黑龍江省醫療質量控制中心，擁有11個省重點學科，普外科被列為國家重點學科（培育學科），心血管內科、神經外科和血液內科為沖擊“十二五”國家重點學科。醫院以技術創新為源動力，實施“專科有特色，專家有特長”發展戰略，每年近百項先進技術應用于臨床。
醫院有臨床醫學、口腔醫學專業，設28個教研室，7個教研組，承擔五年制、七年制教學和留學生、進修生、成人教育的培養任務。臨床醫學為一級學科博士、碩士授予點，口腔臨床醫學為二級學科博士、碩士授予點，是國家優秀示范臨床教學基地。2011年獲得“全國首家五星級示范臨床教學基地”稱號。在院學生3，000余人，年接收進修醫師近400人。
醫院具有較強的科研實力，衛生部細胞移植、省普通高校肝脾外科和省普通高校神經外科重點實驗室均設在醫院。擁有1個省級、7個校級研究所，設40個研究室，醫院設有臨床醫學和口腔臨床醫學博士后科研流動站。醫院發明的亞砷酸注射液被評為國家二類新藥，在中國科學院2000年《科學發展報告》中被稱為20世紀中國十大科技發明之一；醫院研制的雙黃連制劑獲省政府優秀成果獎。近幾年，承擔國家和省重大科研項目近百項，獲國家、部省級科技成果獎數十項。
醫院積極參加社會公益活動，成為多項慈善基金定點醫院，每年定期組織專家醫療隊赴貧困、邊遠地區義診。60年來，多次組建醫療隊應對突發事件，圓滿完成任務，受到上級有關部門的表彰獎勵。2008年“5.12”汶川地震發生后，醫院先后派出71人次前往四川支援抗震救災，被評為省衛生系統抗震救災標兵單位。2010年6月下旬，大興安嶺發生森林火災，醫院立即選派醫療隊支援撲火。8月，伊春發生空難事故，醫院派出專家醫療隊趕赴伊春，參加搶救傷員的工作，收治了14名重傷員，無一人死亡。2011年12月9日，香港游客在吉林省榆樹市發生車禍，連夜緊急轉入醫院后，經多學科晝夜奮戰，針對每個傷員的狀況，進行個性化治療，到12月18日，救治效果顯著，所有香港傷員均平安返回香港，受到省政府表揚。
2012年5月，舍己救人的最美女教師張麗莉病勢危重轉入醫院，經過113天的精心治療，使張麗莉轉危為安，痊愈出院，哈醫大一院出色的救治工作，受到中央政治局委員、國務委員劉延東同志和黑龍江省委書記吉炳軒同志的高度評價。
醫院大力開展國際間學術交流，與美國、日本、加拿大、澳大利亞、英國、法國、荷蘭、意大利、俄羅斯、港澳臺等30多個國家和地區進行友好合作，2012年，經過認真評估考察，成為英國愛丁堡皇家外科學院和香港外科醫學院基礎外科及普外住院醫師培訓中心。每年舉辦國際、國內大型學術會議數十次。
醫院以“團結、奉獻、敬業、創新”為院訓，以“教書育人，為人師表，服務病人，誠信為本”為辦院宗旨，全院教職工堅持以病人為中心，以高尚的醫德、精湛的醫術和嚴謹的醫風，為創建國內一流醫院而努力奮斗。