敦煌市醫院2010年、2013年連續被全國醫院管理協會評為“百姓放心示范醫院”。是甘肅省“十佳醫院”。現開放床位380余張，年門診量14.8萬人次。敦煌市醫院在職職工482人，其中高級職稱專家13人，醫學博士1人、在讀研究生14人，醫院集醫療、教學、科研、預防、保健、康復和急救功能為一體，專科分類齊全，開設婦產科、骨科、普外科、呼吸消化內科、心血管內科、神經內科、兒科、重癥醫學科、中醫康復科、感染科等臨床科室及影像中心、超聲診斷科、檢驗中心和體檢中心、內鏡中心等醫技科室，擁有酒泉市臨床重點專科3個(肝膽胰外科、骨科、兒科)。其中肝膽胰外科的肝包蟲肝葉切除術、腹腔鏡膽囊切除手術在省內同級醫院乃至三級醫院中處于領先水平。
敦煌市醫院擁有GE0ptimaCT660(128T)型64排CT、西門子數字DR攝片機、飛利浦iu22多普勒超聲診斷儀、LOGIQS8彩色超聲多普勒診斷儀、奧林巴斯內鏡系統、西門子移動攝片機、加拿大銳普干式熒光分析儀、德國羅氏全自動電化學發光免疫分析儀、貝克曼全自動生化分析儀、法國梅里埃自動微生物鑒定及藥敏系統全自動分枝桿菌培養檢測系統、希森美康全自動尿沉渣分析儀、美國雅培血氣分析儀等一大批國際先進的醫療設備，為疾病科學診斷奠定了堅實的基礎。
近年來，敦煌市醫院對外交流合作不斷擴大，在國內與北京、天津、蘭州等著名大醫院建立廣泛協作關系;采用引進來送出去的辦法培訓了一大批開放型、高層次醫學人才，有力促進了醫院的科技創新和業務水平的提高。具有國內省內先進水平的新業務、新技術不斷開展，標志著醫院科研水平的新項目、新成果不斷涌現。基礎設施建設取得巨大成果，院容院貌煥然一新，群眾就醫條件根本改善，先后啟用了現代化、人性化的門診大樓和建筑面積1.2萬平方米、配備全新設備的新住院部大樓。兩幢大樓布局合理、功能完善、設施先進、配置一流，為廣大人民群眾治病療疾提供了舒美條件。
敦煌市醫院秉承“厚德博學、務實創新”的院訓，堅持“科技興院、人才興院、管理興院”的辦院方針，造就了一支業務精湛、醫德高尚、紀律嚴明、作風過硬的職工隊伍，樹立了社會滿意、患者信賴的良好形象。醫院獲得省級管理先進單位，市級文明單位，醫院文化建設先進單位等多項榮譽稱號。
新時期下，全院干部職工正在新的起跑點上，以更加昂揚的斗志，更加扎實的作風，向著“更新、更高、更快”的目標而奮勇前進，在醫院前進的征程上承載生命的囑托，鑄就敦煌市醫院新的輝煌，為敦煌醫療衛生事業的發展做出更大的貢獻!。