北京大學神經科學研究所的前身是北京醫科大學神經科學研究所。北京醫學院1965年接受衛生部的任務，開展針刺原理研究。在此基礎上于1987年成立北京醫科大學神經科學研究中心，1994年成立衛生部神經科學重點實驗室，1998年成立神經科學研究所。2000年4月北京醫科大學與北京大學合并成立新的北京大學，該所也相應改名為北京大學神經科學研究所。2001年被批準成立教育部神經科學重點實驗室。
科研成績：
1．獲獎：（1）國家自然科學獎2次：1987年獲三等獎“針刺鎮痛的神經化學機制”；1999年獲二等獎“抗阿片肽CCK作用機制的研究”。（2）國家科技進步獎1次（1999年三等獎：《神經科學綱要》）。（3）部委科技進步獎21次，其中一等獎6次。多年來，該所論文被SCI引用次數占全北醫大論文被引用次數的40％左右（35-44％）。本所（系）建立至今已在國內外發表原著論文400余篇，1998年以來五年間共發表研究論文120篇，其中國外英文SCI刊物收錄32篇，刊物**影響因子16.5。
2．著作：主編《神經科學綱要》（教育部指定研究生用教材），該書第二版已改名為《神經科學原理》，200萬字，分上下兩冊出版（1999）。《針刺鎮痛的神經化學原理》第1卷（1987）、第二卷(1998)共收集該所論文200余篇。《針刺鎮痛原理》(1999)簡述30余年研究之全貌。主編《生理科學進展》和《中國疼痛醫學雜志》，后者的發行量已超過9000份。
3．應用性研究：在闡明針刺鎮痛原理基礎上，設計制造了“韓氏穴位神經刺激儀”(HANS)，被稱為“無針的電針儀”。不僅可以代替扎針治療疼痛等，并可用于治療海洛因成癮，減輕戒斷癥狀，防止復吸。
北京大學神經科學研究所所獲榮譽（1）國家自然科學獎2次：1987年獲三等獎“針刺鎮痛的神經化學機制”；1999年獲二等獎“抗阿片肽CCK作用機制的研究”。（2）國家科技進步獎1次（1999年三等獎：《神經科學綱要》）。（3）部委科技進步獎21次，其中一等獎6次。多年來，該所論文被SCI引用次數占全北醫大論文被引用次數的40％左右（35-44％）。北京大學神經科學研究所
