北京市疾病預防控制中心、北京市預防醫學研究中心是根據國務院關于衛生監督、衛生防病體制改革的總體要求，在北京市衛生防疫站、北京市勞動衛生與職業病防治研究所、北京市健康教育所、北京市性病防治所的基礎上，于2000年6月正式組建的市級衛生事業單位。　　承擔著北京市傳染性疾病、慢性非傳染性疾病、學生常見病、病媒生物傳播疾病等預防與控制;突發公共衛生事件應急處置和疫情報告和信息管理;食品衛生、環境衛生、放射衛生和職業衛生等健康危害因素的監測與干預;全市居民的健康教育與健康促進和科研教學等工作。還承擔著首都重大政治、經濟、社會活動的公共衛生保障、首都生物反恐怖襲擊應急等任務。下設17個業務科所和15個職能科室，工作人員651人，其中專業技術人員606人。　　中心成立以來，在市委、市政府、市衛計委的正確領導和社會各方面的大力支持下，建立起疾病預防與控制、檢測檢驗與評價、應用研究與指導、技術管理與服務、健康教育與促進為一體的疾病預防控制體系，各項工作都呈現出生機勃勃的發展勢頭。