上海市同濟醫院建立于1991年，隸屬鐵道部，冠名為上海鐵道醫學院附屬甘泉醫院，1995年獲評上海第一批三級甲等綜合性醫院，同年與鐵道學院合并醫院更名為上海鐵道大學附屬甘泉醫院，2000年,并入同濟大學，更名為同濟大學附屬同濟醫院，2010年屬地，劃歸上海市地方政府，隸屬上海申康醫院發展中心，由申康中心和同濟大學共同管理，第一冠名上海市同濟醫院，第二冠名同濟大學附屬同濟醫院。是普陀區唯一一所集醫療、教學、科研及預防功能為一體的大型三級甲等綜合性醫院。醫院占地62畝，建筑面積近10萬平方米，萬元以上設備2287臺，擁有3.0TMRI、320排CT、帶PET功能的單光子雙探頭可變角ECT、DSA，以及直線加速器等大型設備。現有員工1900余名，核定床位1100張，是國家臨床藥物試驗機構、衛生部專科醫師培訓基地、上海市住院醫師規范化培養和全科醫師培養臨床基地。承擔了上海市西北地區400余萬居民的醫療保健和一、二級醫院疑難危重病人的會診任務。
　　醫院學科齊全、人才薈萃。擁有教育部重點實驗室、教育部創新團隊。目前臨床醫學一級學科進入上海一流學科Ｂ類建設計劃，即上海市重點學科建設計劃。形成了以心血管內科、骨科和消化內科為重點的優勢學科群，其中心血管內科為上海市重點學科，醫學影像科、兒科、精神醫學科、婦產科、內分泌科、胸心外科和普外科為方向的重點培育學科群，以及以血液科、呼吸科、泌尿外科、腎內科、神經內科和皮膚科為代表的特色專科群。同時擁有"國家有突出貢獻的中青年專家"、"國務院特殊津貼"、"全國'五一'勞動獎章"、"中國醫師獎"獲得者等一批高水平的專家。2010年，同濟大學醫學院干細胞研究同濟醫院臨床轉化中心成立，國家"千人計劃"等一批學者落戶醫院。醫院在臟器康復、生殖醫學、干細胞等新興領域前沿的研究和臨床應用方面快速發展。
　　醫院承擔著碩士、博士研究生、本科生（七、八年制）教育、國家級和市級繼續醫學教育任務，建有臨床醫學博士后流動站，擁有臨床一級學科博士學位授予權，碩士學位授予權，截至2013年底醫院擁有博導41名、碩導89名。擁有教育部優秀骨干教師等為代表的高水平師資隊伍、"衛生部醫學視聽教材上海制作基地"和"同濟大學醫學模擬教學中心"等現代醫學教育示范基地。有著深厚的教學底蘊，有一支良好的教學師資和教學管理隊伍，2014年有關全程教學體系及保障體系的建設獲上海市教學成果一等獎，取得了包括華東賽區醫學生技能大賽特等獎在內的一系列教學獎項和一批上海市重點課程、同濟大學重點課程，在二次教育部本科教育評估中成績優良。
　　醫院高度重視科學研究發展，建有國家級國際科技合作基地“干細胞與再生醫學國際聯合研究中心”、"中美干細胞研究中心"、"SPF級動物實驗室"及GMP細胞制備車間等轉化醫學研究平臺。承擔了“國家科技重大專項新藥創制專項”、“國家973計劃"、"國家863計劃"、"國家科技支撐計劃"和“國家國際科技合作項目”、“國家自然科學基金重大、重點項目”等重大科研項目。2013年，醫院獲批各級各類科研項目77項，其中包括國家自然科學基金重點項目、重大研究計劃等國家級項目37項，當年外來科研經費達3034萬元；發表論文309篇，其中包括《Science》、《Nature》、《CellStemCell》等SCI收錄論文126篇，中華系列雜志論文70篇。醫院累計申報國家專利94項，獲得國家專利60項，獲得國家自然科學獎二等獎、教育部科技進步獎一等獎、上海市醫學科技獎一等獎等科研成果。
　　醫院秉承求實、求精、求信、求達的院訓，始終堅持公益性的辦院方向，在衛生事業改革發展的歷史進程中不畏艱難，銳意進取，形成了同舟共濟，自強不息的院風。醫院培育健康傳播文化，積極參與援摩、援疆、援滇等醫療幫扶工作，堅持把提高人民群眾的健康水平與提升醫療質量、培育醫療特色相結合，堅持溫馨、便捷、優質的服務理念，在上海和全國的醫療衛生、教育科研事業中發揮了重要作用。