復旦大學附屬兒科醫(yī)院創(chuàng)建于1952年，系衛(wèi)生部部署三級甲等醫(yī)院，是集醫(yī)、教、研為一體的綜合性兒童專科醫(yī)院，是全國兒科學重點學科、國家“211工程”和“985”工程建設單位，是最早被國家授予兒科學碩士、博士學位授權點、臨床醫(yī)學（兒科學組）博士后流動站的單位。在中國最佳醫(yī)院專科排行榜中，綜合排名首次居全國兒童醫(yī)院榜首，兒內(nèi)科繼續(xù)名列第一，兒外科繼續(xù)名列第二。多次被評為上海市文明單位。
　　醫(yī)院宗旨：一切為了孩子。醫(yī)院使命：建樹醫(yī)學典范，呵護兒童健康。醫(yī)院定位：立足上海、服務全國、輻射亞洲。醫(yī)院愿景：亞洲一流的兒童醫(yī)學中心，兒科醫(yī)學教育向全國輻射的中心，中外兒科學術交流的重要橋梁。醫(yī)院院訓：團結、奮進、嚴謹、創(chuàng)新。醫(yī)院理念：尊重、平等、熱情、關愛。
　　在各級政府的大力支持和關心下，2008年2月29日，座落于閔行區(qū)萬源路399號的新醫(yī)院經(jīng)過將近4年的建設正式啟用，醫(yī)院主體從楓林路搬遷至新醫(yī)院，原址保留普通兒內(nèi)科門診服務功能，以滿足周邊地區(qū)病人的需求。新醫(yī)院占地153畝，Ⅰ期建筑面積8萬多平方米，核定床位由原來的330張增至600張，現(xiàn)開放床位711張。截止2013年底，職工1396人，博士生導師30名，碩士生導師33名，高級職稱專家118人。
　　醫(yī)院開放床位71張，年門急診服務量逾221萬，出院病人突破3.5萬人次，住院手術近1.6萬。醫(yī)院專業(yè)設置齊全，共設45個臨床醫(yī)技科室，新生兒、重癥醫(yī)學科、小兒消化科、中醫(yī)兒科、新生兒疾病重點實驗室、小兒外科、臨床護理被確定為國家臨床重點專科。新生兒、外科、心血管、傳染病等專業(yè)曾先后被列為衛(wèi)生部臨床學科重點專業(yè)。新生兒科是上海市醫(yī)學重點學科，兒科學是上海市重中之重重點學科，小兒外科是上海市小兒外科疑難重癥臨床醫(yī)學中心，呼吸急救專業(yè)是上海市醫(yī)學領先專業(yè)。
　　醫(yī)院科研實力雄厚，近10年來承擔470項科研課題，經(jīng)費2億元。包括國家自然科學基金重點課題、衛(wèi)生部臨床學科重點專業(yè)、國家“863”、“973”、“十一五”、“十二五”科技支撐計劃等重要項目。
　　2012年醫(yī)院啟動“騰飛計劃”（1125人才工程），利用985創(chuàng)新平臺、重大科技項目或海外特聘教授崗位等吸引海外著名學者來院開展科研合作，先后引入21位國內(nèi)外知名教授作為雙聘PI。醫(yī)院有2個省部級重點實驗室，分別為衛(wèi)生部新生兒疾病重點實驗室和上海市出生缺陷防治重點實驗室。
　　復旦大學上海醫(yī)學院兒科學系設在兒科醫(yī)院，每年承擔七個專業(yè)400余名醫(yī)學生的臨床教學與實習培養(yǎng)。已為全國各地培養(yǎng)進修醫(yī)生6000余名，每年培養(yǎng)長期進修學員200余名，每年培養(yǎng)短期參觀學習學員200余名。每年舉辦近30-40期國家級繼續(xù)教育學習班。做為上海市住院醫(yī)師規(guī)范化培養(yǎng)基地，每年培養(yǎng)30余名住院醫(yī)師，2012年做為上海市專科醫(yī)師培養(yǎng)基地開始進行專科醫(yī)師規(guī)范化的培養(yǎng)。每年培養(yǎng)博士研究生20余名，碩士研究生40余名.
　　醫(yī)院每年接待外賓講學、交流100余次。醫(yī)院先后與美國、加拿大等國家的20多個國際上知名的醫(yī)學機構和國內(nèi)20多個單位建立密切協(xié)作關系。醫(yī)院平均每年主辦3次大型兒科國際學術會議，近兩年分別成功主辦孤獨癥研究國際合作發(fā)展論壇、第43屆太平洋小兒外科年會、第16屆國際兒科腎臟病大會。
　　近11年來(2003年-2013年)獲學科建設和科研項目共計286項，其中國家級課題121項，SCI收錄論文550篇（近4年來295篇），獲省部級以上獎項28項。并出版《實用新生兒學》、《小兒感染病學》、《現(xiàn)代實用兒科學》等十余部重要專著。主辦《中國兒科循證雜志》進入國家核心期刊，并與美國兒科學會協(xié)作主辦《Pediatrics中文版》。
　　兒科人以“一切為了孩子”為宗旨，以“團結、奮進、嚴謹、創(chuàng)新”的院訓勉勵自己，貫穿“以人為本”的服務理念，構建和諧穩(wěn)定的醫(yī)院文化，營造規(guī)范有序的良好氛圍，在全國享有較高的聲譽。