深圳市兒童醫院位于市中心區，1998年初正式開院，是一家集醫療、保健、科研、教學為一體的現代化綜合性兒童醫院和兒科急救中心，為深圳及周邊十幾個地區兒童提供醫療保健服務。2017年，被評為三級甲等兒童綜合專科醫院。醫院總建筑面積近17萬平方米，開放床位1254張。現設有12個兒內科病區、8個兒外科病區及重癥醫學、耳鼻喉、中醫、康復等病區，專業設置齊全，涵蓋了大型綜合兒童醫院全部業務科室。目前年門、急診量230.4萬人次，年住院量7.68萬人次，年手術量3.09萬例。醫院擁有價值逾5.4億的先進診療設備，包括3.0T磁共振、64排螺旋CT、DSA、24小時動態腦電圖、128H和64H數字化視頻腦電圖儀、血濾／血透器、氣質聯用儀、串聯質譜儀、流式細胞儀等，配有先進的無菌層流手術間19間，其中一體化手術間2間，DSA手術間1間，雜交手術室1間。
　　深圳市兒童醫院是中國醫科大學、汕頭大學深圳兒科臨床學院，重慶醫科大學非直屬附屬醫院，遵義醫學院、錦州醫科大學等院校研究生培養基地。現有職工2022人，高級職稱專業人才350人。其中，博士生導師6人，碩士生導師68人；博士后4人；享受國務院特殊津貼者1人，深圳市政府津貼者2人，歸國高級人才14名；博士后4人，醫學博士82人，碩士452人。近五年，醫院共獲各級各類科研立項200余項，包括國家科技部“863”課題，國家自然科學基金重點項目，國家自然科學基金面上、青年項目，國家衛生部衛生行業科研專項重大課題，廣東省自然科學基金項目，深圳市科創委重點項目等，縱向科研經費1億余元。近3年發表SCI論文108篇，包括在《新英格蘭雜志》等權威期刊上發表論文，最高影響因子79.258。牽頭、執筆及參與制定國際國內指南標準20余部，承辦全球頂級學術會議第10屆世界兒科感染性疾病大會并發布由我院執筆的《中國兒童合理使用抗菌藥物行動計劃（2017-2020）》。醫院重視學科建設，經過十幾年的拼搏和積累，人才隊伍建設已經達到較高水平。兒科被評為廣東省高水平臨床重點專科，小兒呼吸專業為廣東省“十二五”醫學重點學科，小兒風濕與免疫專科為廣東省臨床特色專科，中醫兒科為廣東省中醫兒科重點專科單位，擁有若干市級重點專科；“深圳兒童重癥疾病診斷重點實驗室”、“深圳病原體高通量基因測序技術工程中心”、“藥物臨床試驗基地公共服務平臺”、“免疫系統人源化小鼠模型研發公共服務平臺”、“深圳小兒血液腫瘤分子醫學公共服務平臺”等工程載體先后立項，醫院引進國內外高水平醫學團隊9個，其中國際團隊3個。
　　醫院十分注重人才建設，成功引進或培養了一批具有高學術影響力和地位的學科帶頭人和學科骨干，涵蓋海外高層次人才B類、C類，實用型人才Ⅰ類、Ⅱ類等。現有國家級學術團體主任、副主任委員15人、學組組長、副組長13人，常委25人、委員159人，中華醫學會、中華預防醫學會、中華口腔醫學會、中華中醫藥學會各專業組委員79人，其中中華醫學會放射學分會兒科專業委員會副主委1人，中國醫藥教學協會超聲醫學專業委員會兒童超聲學組主任委員1人，中國中西醫結合學會兒科專業委員會副主任委員1人，中國醫師協會各專業委員會副主委3人，中國康復醫學會健康管理專業委員會副主委1人，中國研究型醫院學會兒科學專業委員會副主委2人，中國睡眠研究會兒童睡眠醫學專業委員會副主委1人，中國婦幼保健協會各專業副主委2人；《中國當代兒科雜志》副主編1人，《中華兒科雜志》、《中華小兒外科雜志》、《中華耳鼻喉頭頸外科雜志》、《中華超聲影像學雜志》等各級雜志編委或通訊編委73人；省級學術團體副主任委員24人，廣東省醫學會兒科學分會副主委3人、小兒外科學分會副主委各1人，廣東省口腔醫學會各專業副主委3人，廣東省醫師協會兒科分會副主委2人；同時是深圳市醫學會兒科分會、深圳市醫師協會兒科分會及深圳市中西醫結合學會兒科分會主委單位。
　　二十年創業，彈指一揮間。深圳市兒童醫院將力爭邁進中國一流兒童醫院先進行列，以一流的服務、一流的管理、一流的技術為患兒提供優質的醫療服務，實現社會、醫院、職工三方共贏。