孫逸仙是孫中山先生早年學醫、行醫時用過的名字。深圳是孫中山先生早期從事中國民主革命的地區之一。
一九八五年孫中山先生的孫女孫穗芳女士向當時出訪美國的前國家主席李先念同志建議，在深圳建立“孫逸仙心血管醫院”，以此紀念孫中山先生，宣傳孫中山先生的志愿和理想，擴大深圳在海外的影響，同時為祖國的醫療衛生事業做貢獻。
　　經李先念主席批準，在原全國人大副委員長、民革中央主席朱學范的大力支持下，在國家計委、衛生部、深圳市委和深圳市政府的共同努力下，深圳市孫逸仙心血管醫院于一九九二年十一月十二日孫中山先生誕辰紀念日正式開院。
　　李先念主席親筆提寫了“孫逸仙心血管醫院”院名。原全國政協副主席、民革中央主席屈武為在醫院院中的孫中山先生銅像提寫碑文“偉大的革命先行者孫中山先生”。醫院內設有原全國人大副委員長、原民革中央主席何魯麗題寫堂名的“中山紀念堂”。
　　深圳市孫逸仙心血管醫院是深圳市衛生局屬市級醫院，深圳唯一的心血管專科醫院，是深圳市社會保險局定點醫院。
　　醫院主要技術骨干來自中國醫學科學院、解放軍總醫院、全國各大城市重點醫院和衛生部重點院校，還有一批從美國、英國、德國、比利時、澳大利亞和日本留學回國的心血管病專家，形成了一支技術力量雄厚的心血管技術專科隊伍。
　　深圳市孫逸仙心血管醫院目前是深圳市和華南地區唯一的一所心血管病專科醫院，集臨床、科研、教學為一體，是廣東省心臟移植準入資格的兩家醫院之一，現開放專科床位150張。
　　近幾年來，隨著醫院發展的加速，深圳市心血管疾病就診患者增多，醫院舊址診療環境及硬件設施的制約作用日益突出，已不能很好地滿足群眾的就醫需求。市孫逸仙心血管醫院遷址新建項目于2006年獲市發改委批復立項，是深圳市重點民生工程之一。該項目基建政府總投資5.14億元，選址在南山區朗山路，項目占地面積22458.16平方米，總建筑面積88470平方米，建設規模500張病床。遷址新建項目2012年11月奠基并移交給深圳市建筑工務署建設，新院主體結構已經封頂，預計2016年底正式投入使用。
　　醫院位于深圳市東門北路，目前醫院占地面積7000平方米，建筑面積9000平方米，開設有心內科、心外科門診、急診科以及病理、放射、超聲、藥劑、核醫學、麻醉、檢驗、心電圖等科室。其中冠心病外科治療、內科介入治療和外科嬰幼兒先心病科是重點專科，尤其是嬰幼兒先心病外科是廣東省重點專科和廣東省“五個一工程”重點專科。現有病床120張(其中普通床位100張、ICU床位10張、CCU床位10張)。
　　醫院主要技術骨干來自中國醫學科學院北京阜外醫院、301醫院、美國、英國、德國、比利時、澳大利亞和日本留學回國的心血管病專家。醫院目前共有職工314人，其中衛技人員250名，執業醫師92名。其中主任醫師28名，副主任醫師57名，博士后2名，博士5名，碩士33名，已建立起一支技術力量雄厚的心血管專科技術隊伍。
　　2001年3月市政府又批準成立市心血管病研究所，依托醫院人才與資源優勢，開展心血管病研究工作。2003年12月醫院被評為全省唯一A級心臟移植準入單位
　　醫院擁有世界一流的各種心血管專科設備，包括兩臺深圳市僅有的德國西門子1250毫升雙C型臂及雙向數字減影心血管造影機、64排螺旋CT、功能最佳的美國Acuson彩色多普勒診斷儀、血管內超聲機、多功能X線機、單光子電子計算機斷層γ照相機、西門子麻醉機、斯托克體外循環機、西門子和惠普監護儀等現代化醫療設備。
　　在冠心病、先心病和瓣膜病的臨床治療方面，在全市處于絕對領先地位，在廣東省乃至華南地區處于先進水平。醫院已經完成冠狀動脈搭橋手術600余例。手術成功率從初始的92%達到現在的98%。在手術的術式、基本方法等諸多方面，基本上保持了與國際水平同步。醫院的嬰幼兒先天性心臟病外科于1996年被廣東省衛生廳評定為“五個一科教興醫重點專科”。在已完成的1800余例嬰幼兒先心病手術中，取得良好效果。手術死亡率低于4.78%，并發癥發生率低于9.82%，手術水平在國內處于領先地位，接近國際先進水平。其中成功完成了國內首例右肺動脈起自降主動脈根治術、完全性房室管畸形、完全性肺靜脈異位引流、三尖瓣閉鎖、肺動脈瓣閉鎖、單心室、大動脈轉位等多種復雜畸形根治術及分流術。1999年8月13日，更成功完成了一例出生僅39小時新生兒復雜先心病手術，創造了國內新生兒心臟手術最小年齡的記錄。
　2002年至今已完成擴張型心肌病同種原位心臟移植10例，全部獲得成功，其中有兩例是同時進行的(尚屬國內首例)
l近年來特別是大血管專科正處于迅猛發展階段，省內領先，達到國內大血管病外科診治水平。
　　l完成廣東首例全主動脈置換手術;
　　lBentall’s手術，David’手術
　　l主動脈次全弓置換術
　　l主動脈全弓置換術
　　l象鼻支架植入術
　　l主動脈覆膜支架植入術
　　l深低溫停循環、選擇性腦灌注技術
　　l升主動脈置換術
　　醫院在介入性心臟病臨床應用方面具廣東省先進水平，在心血管造影、冠狀動脈造影、大血管數字減影、冠狀動脈PTCA和冠脈內支架、經皮股動脈球囊成形、冠脈內溶栓、肺動脈瓣球囊成形、心內電生理和射頻消融、AICD、植入雙腔和三腔起搏器等方面填補了深圳市的空白。在1994年純經靜脈途徑成功地安置了ICD填補了國內的一項空白。醫院在介入性診斷的成功率大于99%，介入性治療的成功率大于97%。
　　醫院嬰幼兒先天性心臟病外科系廣東省和深圳市兩級重點專科，冠心病外科、介入心臟病學系深圳市重點專科，終末期心臟病的治療系廣東省特色專科。