南溪山醫院是自治區第二人民醫院。其前身—中國桂林南溪山醫院，是由外交部、外經委和衛生部于1968年組建的援越醫院。1975年援越醫療任務結束后，醫院更名為廣西壯族自治區南溪山醫院，是直屬自治區衛生廳的省級綜合性醫院。
　　南溪山醫院開設病床700張；在編員工1100多人，其中副高級職稱以上專家100多人，碩士生導師4人；設置醫療專科32個，病區27個，醫技專科11個，專業實驗室11個，臨床教研室12個；以胸心血管外科、神經外科、心內科、內分泌科等為院級重點學科，腎科、泌尿外科、腫瘤科、麻醉科、眼科、皮膚性病科、核醫學科、醫學影像學科、檢驗科、腫瘤實驗室等為優勢學科。醫院裝備有瑞典醫科達公司precise醫用直線加速器、數字減影血管造影系統、核磁共振成像系統、雙探頭SPECT顯像系統、高強度聚焦超聲腫瘤治療系統（海扶—刀）、數字化X線攝影系統、CT、百勝DU6全身彩超、菲利普HDI－4000全身彩超、全自動生化儀、體外循環系統、人工肝系統等大型醫療設備。醫院信息化建設自1996年起，先后投入260多萬元，建立了以醫院信息、檢驗、保健、醫保異地聯網、病案統計、電子病歷、辦公自動化和病案信息管理等系統為主體的數字化軟件體系。
　　南溪山醫院先后通過了ISO9001/ISO14001質量/環境一體化管理體系認證，評定為三級甲等醫院、A級教學醫院、衛生部國際緊急救援中心網絡醫院、愛嬰醫院、自治區文明醫院、綠色環保醫院、全國百姓放心醫院。2005年成為桂林醫學院非直屬附屬醫院。