阜陽市第二人民醫院始建于1972年，前身為阜陽行署傳染病醫院，1997年在全國?？漆t院中首家按照綜合醫院標準通過二級甲等綜合醫院評審，2011年初在全省首家通過三級甲等傳染病?？漆t院評審，正式成為以“強?？啤⒋缶C合”為特色的三級甲等醫院，安徽醫科大學阜陽臨床學院和研究生班教學點，蚌埠醫學院教學醫院，多項診療技術居阜陽市領先水平，是皖西北地區醫療、預防、教學、研究中心之一，醫療服務范圍輻射周邊省、市地區。年門急診總量達45萬人次，住院病人達三萬人次。
　　全院占地面積6.07萬平方米，是阜城占地規模最大的醫院，擁有固定資產2.6億元，在職職工1100余人，其中高中級專業技術人員650人，編制床位1000張，實際開放床位1200張。傳染病部分設有感染一科、感染二科、感染病ICU、應急病區、結核病科、肝病一科、肝病二科、肝病三科；內科部分設有呼吸內科、腎病科、血液透析中心、心血管內科、神經內科、內分泌血液科、消化內科、腫瘤內科、干部（特需）病房；外科部分設有普外科、胸心外科、神經外科、泌尿外科、血管外科、骨一科、骨二科、婦科、產科、男科、皮膚科；其它臨床學科設有兒科、急診科、重癥醫學科、耳鼻喉科、口腔科、眼科、高壓氧科、麻醉科、手術室；醫技科室設有CT室、磁共振室、放射科、介入診療科、超聲科、功能檢查科、檢驗科、PCR實驗室、病理科、系列內鏡檢查科等50個學科，以及中西醫結合肝病研究所和健康體檢中心。其中呼吸科為安徽省臨床醫學特色學科，腎臟病科為阜陽市臨床醫學重點學科，血液凈化科、骨科、胸心外科、肝病科、感染科和結核科為阜陽市特色學科。
　　擁有日本東芝64排螺旋CT、荷蘭飛利浦1.5THP磁共振、美國GE1000mALCE+型數字減影血管造影機（大C臂）、美國GE數字X線攝影（DR）、美國柯達CR，德國西門子直線加速器、日本島津800mAX光機、飛利浦IU22型彩超、彩色多普勒數字化超聲，日本全自動生化分析儀，美國雅培AXSEM血液分析儀及全自動免疫發光分析儀，愛爾蘭NPB-840型、Servo-s、Servo-I等系列呼吸機，德國費森尤斯4008B型、4008S型、德國貝朗Dialong+型和瑞典金寶AK90型、AK95型系列血液透析機，歐林巴斯系列纖維支氣管鏡、電子胃鏡、結腸鏡，瑞士EMS氣壓彈道碎石機，德國狼牌腹腔鏡、胸腔鏡、膽道鏡、宮腔鏡、前列腺電切，高壓氧艙、德國貝朗CRRT人工肝支持系統等一系列高新醫療設備。
　　該院堅持以病人為中心，以質量為核心，以科技為先導，近年曾獲部、省、市級科技成果獎76項，能夠開展多種?？茖２≈委熀鸵呻y手術。多次成功有效應對非典、人禽流感、手足口病、甲型H1N1流感等突發公共衛生事件重癥病人救治工作。2003年，院黨委被中央組織部授予“全國非典防治先進基層黨組織”，醫院被國家人事部、衛生部聯合授予“全國非典防治先進單位”；2006年和2007年連年分別榮立阜陽市人民政府人禽流感救治工作和5·4氨中毒救治工作集體二等功；2006年5月被省衛生廳表彰為“安徽省人禽流感救治工作先進單位”；2006年底被評為阜陽市誠信醫院；2007年、2009年2011年8月，連續三次被評為阜陽市第五屆、第六屆、第七屆文明單位；2011年10月，被省委、省政府評為第九屆安徽省文明單位；2008年3月被省衛生廳評為全省衛生系統先進集體，10月被省政府評為安徽省手足口病防治工作先進集體；2011年9月，被市政府評為阜陽市先進集體；并多次被阜陽市委、市政府命名為全市衛生工作先進單位，阜城窗口行業“十佳單位”、“最佳優質服務先進單位”、“行風建設先進單位”、“科技工作先進單位”和“十佳黨委”等光榮稱號。